130-ти процессорный кластер CLI - X имеет в своем составе:
- 10 2-х процессорных узла на основе процессоров Intel Xeon 3.6 GHz c кэшем 2 MB и частотой системной шины 1066 MHz , EM 64 T , ОП 10 x 4 x 1 GB , HDD SATA 10 x 250 x 2 GB 7200 об/мин; - 3 2-х процессорных узла на основе процессоров Intel Xeon 3.8 GHz c кэшем 2 MB и частотой системной шины 1066 MHz , EM 64 T , ОП 3х4 x 1 GB , HDD SATA 3 x 250 x 2 GB 7200 об/мин; - 2 2- x процессорных узла на основе 2-х ядерных процессоров Intel Xeon 5160 c кэшем 4 MB , тактовой частотой 3.0 GHz и частотой системной шины 1333 MHz , ОП 2 x 6 x 1 GB , HDD SATA 2 x 320 x 2 GB 7200 об/мин; - 12 2- x процессорных узла на основе 4-х ядерных процессоров Intel Xeon 5345 c кэшем 8 MB , тактовой частотой 2.33 GHz и частотой системной шины 1333 MHz , ОП 12х6 x 2 GB , HDD SATA 12 x 400 x 2 GB 7200 об.мин; - транспортная сеть - Gigabit Ethernet ; - коммуникационная сеть - 2 xGigabit Ethernet . Операционная система - SLC Linux 4.2., SLC Linux 4.5. Система пакетной обработки - Torque 2.0.0 p 0, Torque 2.0.0 p 8 Компиляторы - лицензионные Intel Fortran Compiler 9.0 - 9.1 вместе с пакетами библиотек IMKL 8.0 - 8.1, Intel C / C ++ 9.0 - 9.1. |
Кластер CLI - X |
В 2007-м году приобретены и установлены лицензионные пакеты фирмы Intel для трассировки и профилирования параллельных программ (с использованием интерфейса MPI ) - Intel Trace Analyzer and Collector 7.0 и Intel VTune Perfomance Analyzer 8.0, а также кластерная версия пакета библиотек Cluster IMKL 9.0 вместе с пакетом SCALAPACK . Приобретена и установлена лицензионная версия параллельного варианта программы Gaussian 03 D 01 вместе с программой Linda для архитектуры EM 64 T .
Установлены параллельные варианты квантово-химической программы Gamess -2005, Gamess -2006, Gamess -2007 (сокетный вариант), программы Dalton 2 для расчетов возбужденных состояний, программы CPMD -3.11.1 и Namd 2 для вычислений в области молекулярной динамики. На всех узлах кластера установлена SMP -версия отечественного комплекса для квантово-химических вычислений "Природа".
Пиковая производительность кластера - 1,18 TeraFlops .
Область применения - 32-ти и 64-ти разрядные вычисления в области квантовой химии и молекулярной динамики, а также газодинамики.
Запуск кластера в эксплуатацию - 2006 год.
Upgrade - 2007 год.
Upgrade - 2008 год.
2008-2009гг - увеличение оперативной памяти узлов кластера до максимально возможной: Всего- 164 GB.
2010г - установлены параллельные варианты квантово-химических комплексов программ Gamess-2009, PCGamess (FireFly7.1), Namd2.7b1 и Namd2.7b2, CPMD-3.13.2, NWChem5.1 и NWChem5.1.1, Orca2.7.0, свободно распространяемый аналог программы VASP - версии PWscf4.0 и PWscf4.2. Получена и установлена некоммерческая версия компилятора IFC11.1 вместе с IMKL10.2.
